Wojskowa Komenda Uzupełnień realizuje zadania związane z zabezpieczeniem pokojowego i mobilizacyjnego uzupełnienia jednostek wojskowych, formacji obrony cywilnej i jednostek przewidzianych do militaryzacji oraz zadań związanych z administrowaniem zasobami osobowymi i etatowymi świadczeniami rzeczowymi, a także zadaniami rekonwersyjnymi. Wojskową Komendą Uzupełnień w Nowym Targu kieruje ppłk mgr inż. Andrzej Bandoła. Odpowiada on za kierowanie i zdolność bojową oraz wszechstronne przygotowanie do działania stanu osobowego, a zwłaszcza za realizację przedsięwzięć związanych z osiąganiem gotowości do podjęcia działań, stopni gotowości alarmowej i gotowości mobilizacyjnej, ochronę informacji niejawnych, bezpieczeństwo teleinformatyczne i fizyczne zabezpieczenie Wojskowej Komendy Uzupełnień, dyscyplinę, porządek wojskowy, organizację pracy, sprawność techniczną oraz stan utrzymania uzbrojenia i sprzętu wojskowego będącego na wyposażeniu Wojskowej Komendy Uzupełnień.